Проститься с отцом Николаем пришли родные и близкие, клирики, монашествующие и миряне Санкт-Петербургской митрополии. Среди молящихся был губернатор Александр Беглов.
Его Святейшество возглавил чин отпевания. Предстоятелю сослужили митрополит Санкт-Петербургский и Ладожский Варсонофий, епископы Выборгский и Приозерский Игнатий, Тихвинский и Лодейнопольский Мстислав, Петергофский Силуан, Гатчинский и Лужский Митрофан, а также секретарь епархиального управления протоиерей Сергий Куксевич, настоятель протоиерей Николай Брындин с клиром, протоиереи Богдан Сойко, Владимир Сорокин, Александр Будников, иерей Павел Ермошкин и другие священнослужители.
Патриарх Кирилл обратился к верующим с первосвятительским словом.
Похороны протоиерея Николая Гундяева прошли на Никольском кладбище Александро-Невской лавры.